52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1145 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  100 
 
 		 388 aa  790    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  46.89 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  27.59 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  28.35 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  30.39 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  27.18 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  26.94 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  26.91 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  26.91 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  26.32 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  25.62 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  25 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  23.5 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  24.91 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  24.62 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  22.65 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  22.39 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  22.65 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  22.78 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  23.17 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  23.43 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  22.53 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  24.13 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  24.38 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  23.92 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  23.88 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  23.42 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  24.13 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  23.88 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  24.05 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  24.13 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  23.94 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  24.25 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  23.94 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  23.35 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  23.12 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  25.31 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  23.94 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  21.37 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  24.62 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  22.33 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  22 
 
 		 475 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  22.01 
 
 		 475 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  35 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  22.81 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  24.71 
 
 		 485 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  23.86 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  23.38 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  36.36 
 
 		 478 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  36.36 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  25.94 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  25.94 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>