28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4415 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  80.58 
 
 		 309 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1577  hypothetical protein  29.61 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0247131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3802  hypothetical protein  30.56 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  28.72 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0012  hypothetical protein  27.78 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  36.56 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  35.48 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  37.36 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  37.65 
 
 		 225 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  35.63 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 497 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  32.35 
 
 		 877 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1462  hypothetical protein  36.92 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661828  hitchhiker  0.000296073 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  35.9 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  36.71 
 
 		 462 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  31.18 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  32.69 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  37.04 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  31.76 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0619  hypothetical protein  30.3 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0699  hypothetical protein  30.3 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.951363  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2775  hypothetical protein  27.35 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.731161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  31.94 
 
 		 231 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  32 
 
 		 123 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  32.91 
 
 		 405 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>