More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2272 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  100 
 
 		 453 aa  899    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  42.13 
 
 		 463 aa  299  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  41.82 
 
 		 471 aa  282  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  42.61 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  41.14 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  40.49 
 
 		 462 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  37.39 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  38.51 
 
 		 480 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  39.61 
 
 		 464 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  40.93 
 
 		 473 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  39.22 
 
 		 470 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  37.82 
 
 		 462 aa  256  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  38.67 
 
 		 465 aa  255  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  38.51 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  38.51 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  38.99 
 
 		 467 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  36.92 
 
 		 458 aa  251  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  36.71 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  40.62 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  38.24 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  41.31 
 
 		 459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  40.2 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  36.83 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  37.3 
 
 		 462 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  34.47 
 
 		 466 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  37.08 
 
 		 461 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  36.84 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  38.41 
 
 		 452 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  35.89 
 
 		 454 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  35.89 
 
 		 460 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  38.85 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  34.09 
 
 		 470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  36.98 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  32.57 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  34.22 
 
 		 462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  35.28 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  34.84 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  35.13 
 
 		 482 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  33.41 
 
 		 463 aa  203  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  34.92 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  35.03 
 
 		 447 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  35.9 
 
 		 452 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  36.09 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  28.64 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  31.8 
 
 		 441 aa  193  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  28.29 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  34.87 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  35.68 
 
 		 452 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  28.29 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  37.47 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  32.76 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  31.45 
 
 		 448 aa  189  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  34.88 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  33.33 
 
 		 455 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  32.13 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.73 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  28.88 
 
 		 457 aa  186  7e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  31.01 
 
 		 446 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  32.74 
 
 		 439 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.95 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  36 
 
 		 450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  38.8 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  32.91 
 
 		 454 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  31.35 
 
 		 468 aa  180  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  31.66 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  35.22 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  37.87 
 
 		 453 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  33.09 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  34.76 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  34.78 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  34.78 
 
 		 474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  34.78 
 
 		 474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  35.4 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  33.83 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  34.31 
 
 		 429 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  33.24 
 
 		 1365 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  33.33 
 
 		 1380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  33.06 
 
 		 1373 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  33.06 
 
 		 1373 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  32.17 
 
 		 469 aa  162  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  32.79 
 
 		 1373 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  32.79 
 
 		 1373 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  32.79 
 
 		 1373 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  32.79 
 
 		 1373 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  32.79 
 
 		 1373 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  31.78 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  32.58 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  30.47 
 
 		 463 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  36.01 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  29.27 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  36.62 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  31.81 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  27.23 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  28.07 
 
 		 525 aa  156  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  31.88 
 
 		 1074 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  31.68 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  33.16 
 
 		 1055 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  29.28 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  29.14 
 
 		 495 aa  153  8e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  37.19 
 
 		 1053 aa  153  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>