209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0815 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  100 
 
 
242 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  55.97 
 
 
243 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  55.56 
 
 
243 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  55.14 
 
 
261 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  52.07 
 
 
244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  50.21 
 
 
244 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  42.92 
 
 
259 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  44.49 
 
 
268 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  41.15 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.24 
 
 
260 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.44 
 
 
264 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  39.09 
 
 
268 aa  141  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  38.96 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  41.59 
 
 
257 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  38.49 
 
 
258 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  39.17 
 
 
236 aa  138  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  41.2 
 
 
267 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  38.53 
 
 
235 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.53 
 
 
235 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  37.13 
 
 
356 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  38.59 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  37.34 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  39.04 
 
 
251 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  36.29 
 
 
245 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  37.28 
 
 
255 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  35.86 
 
 
245 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  37.23 
 
 
244 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  38.67 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  39.11 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  38.86 
 
 
224 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.68 
 
 
257 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  38.7 
 
 
224 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  38.26 
 
 
234 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  33.64 
 
 
208 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.16 
 
 
213 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.43 
 
 
219 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  37.73 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  36.73 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  35.65 
 
 
265 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  35.09 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  34.56 
 
 
209 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  36.61 
 
 
228 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  37.66 
 
 
224 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  36.52 
 
 
208 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  37.3 
 
 
264 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  36.82 
 
 
249 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  30.24 
 
 
223 aa  99  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  32.49 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  31.78 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  37.61 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  29.79 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  37.44 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  33.48 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  33.61 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  33.05 
 
 
233 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  28.51 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  28.51 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  28.51 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  29.79 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  28.51 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  28.51 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  30.64 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  30 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  29.29 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  30.42 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  26.46 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  32.89 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  34.67 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  31.47 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  31.28 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.07 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.07 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43482  predicted protein  27.05 
 
 
1225 aa  69.3  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  27.69 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  27.71 
 
 
361 aa  68.6  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  31.11 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  28.75 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  29.8 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3228  putative serine/threonine protein phosphatase  29.7 
 
 
375 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.420131 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  25 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  25.81 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3015  putative serine/threonine protein phosphatase  40.37 
 
 
117 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  33.15 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2077  serine/threonine protein phosphatase  28.36 
 
 
375 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  26.45 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1552  Phosphoprotein phosphatase  28.94 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1633  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  27.94 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  31.68 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1939  metallophosphoesterase  26.13 
 
 
375 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.68081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  25.42 
 
 
241 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4095  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
334 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590494  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  32.79 
 
 
864 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  30 
 
 
830 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  27.76 
 
 
870 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3471  phosphoprotein phosphatase  26.96 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.899378  hitchhiker  0.000399587 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38815  predicted protein  31.46 
 
 
396 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.677964  normal  0.660881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>