103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3069 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3069  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000134505  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0413  hypothetical protein  38.22 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.229359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0473  hypothetical protein  38.22 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.353455  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01892  hypothetical protein  37.79 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  36.08 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  36.77 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  36.13 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  37.42 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  35.48 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  35.48 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  35.48 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2897  hypothetical protein  38.22 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1237  protein of unknown function DUF615  35.48 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002396  putative alpha helix protein  33.33 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  35.22 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  35.22 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  35.22 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  35.22 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  35.22 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  35.22 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  35.22 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  34.59 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  34.18 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  34.18 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  34.18 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  34.84 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  35.48 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0596  hypothetical protein  31.61 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  32.91 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  33.54 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1238  hypothetical protein  30.67 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  34.78 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0352  hypothetical protein  32.48 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  33.12 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  32.93 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00272  hypothetical protein  32.32 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  31.87 
 
 		 203 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  32.93 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04102  hypothetical protein  33.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  33.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  30.95 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4487  hypothetical protein  33.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4804  hypothetical protein  33.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  33.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4712  hypothetical protein  33.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4850  hypothetical protein  33.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  33.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04066  hypothetical protein  33.55 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  30.97 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  33.14 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  32.73 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0491  hypothetical protein  32.08 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  31.68 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  34.19 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  34.19 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  34.19 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  34.19 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  34.19 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  33.12 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  28.99 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  28.99 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0421  hypothetical protein  34.53 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0192  hypothetical protein  31.9 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0148149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  31.48 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  29.68 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  28.4 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0021  hypothetical protein  32.08 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  28.66 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  31.29 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  33.55 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  29.68 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1395  hypothetical protein  32.05 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2837  hypothetical protein  28.98 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  30.67 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0970  protein of unknown function DUF615  28.74 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4260  hypothetical protein  30.54 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.541148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1335  hypothetical protein  30.19 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.154229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  29.3 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2322  hypothetical protein  26.79 
 
 		 225 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0300242  normal  0.462605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1052  hypothetical protein  28.41 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2083  protein of unknown function DUF615  32.28 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.363472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2078  hypothetical protein  28.32 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  26.83 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  26.83 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  30.25 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  31.47 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  30.06 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  32.9 
 
 		 182 aa  47.4  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  26.22 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  26.22 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  26.22 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3553  protein of unknown function DUF615  27.78 
 
 		 218 aa  47.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2265  protein of unknown function DUF615  30.07 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4464  hypothetical protein  30.37 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000293332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4155  hypothetical protein  31.34 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>