71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1832 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1832  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  167  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1845  hypothetical protein  45.33 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  40.54 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 596 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  32.93 
 
 		 614 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  32.91 
 
 		 597 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2142  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  33.77 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1719  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  34.18 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.71494  normal  0.464231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3292  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  32.5 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0470  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.25 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000044174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2480  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.87 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.907179  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  29.33 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  35 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  35.59 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  35.19 
 
 		 569 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  31.17 
 
 		 653 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0531  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.49 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00863384  normal  0.0986491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  25 
 
 		 597 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  25 
 
 		 645 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  25 
 
 		 645 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  26.67 
 
 		 666 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.11 
 
 		 636 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  29.69 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1449  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.33 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  29.11 
 
 		 636 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2081  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.17 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.410496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 		 595 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  26.58 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  26.58 
 
 		 597 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 		 623 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  31.15 
 
 		 575 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  30 
 
 		 626 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1172  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.17 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0911  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  31.17 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0933  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.17 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1273  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  26.83 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308673  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2805  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  34.62 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.327427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  29.82 
 
 		 570 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  28.92 
 
 		 623 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  29.11 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1636  NADP-reducing hydrogenase chain A  24.05 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000374752  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  34.25 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  31.76 
 
 		 562 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  23.4 
 
 		 624 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3518  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  24.05 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  40.82 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3831  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  23.17 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  25 
 
 		 620 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  31.03 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0423  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  29.33 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0995  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.08 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.41379  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  26.39 
 
 		 667 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  26.32 
 
 		 641 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  28.75 
 
 		 219 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1846  NADP-reducing hydrogenase chain A  28.57 
 
 		 168 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  24.39 
 
 		 614 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  27.5 
 
 		 597 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0147  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  25.97 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3599  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  25.93 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  25.3 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  24.21 
 
 		 570 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1602  NADP-reducing hydrogenase chain A  22.78 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  28.75 
 
 		 596 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  30 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4053  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  24 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.199987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  40 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4167  bidirectional hydrogenase complex protein HoxE  25.35 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1372  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  37.14 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1087  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.26 
 
 		 164 aa  40  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.865762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>