23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0899 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0899  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1314    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1317  zinc finger SWIM domain-containing protein  55.35 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1893  hypothetical protein  46.17 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00616409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0735  hypothetical protein  29.37 
 
 		 639 aa  261  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1324  hypothetical protein  55.56 
 
 		 184 aa  196  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  23.39 
 
 		 608 aa  81.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  23.15 
 
 		 611 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  39.76 
 
 		 580 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  41.76 
 
 		 848 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.55 
 
 		 142 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  33.77 
 
 		 570 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  38.27 
 
 		 266 aa  48.9  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  35.8 
 
 		 266 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  38.55 
 
 		 273 aa  47.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 		 1113 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  35.44 
 
 		 1113 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1036  SNF2 helicase associated domain-containing protein  37.18 
 
 		 832 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  34.29 
 
 		 656 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.52 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  32.18 
 
 		 1086 aa  45.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  27.96 
 
 		 1084 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  25 
 
 		 613 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  34.09 
 
 		 566 aa  43.9  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>