32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0383 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0383  MshA biogenesis protein, MshJ-like  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0387  MSHA biogenesis protein MshJ  35.4 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0891  hypothetical protein  36.41 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0467  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHJ)  32.52 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4578  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0751  hypothetical protein  34.06 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0331  MSHA biogenesis protein MshJ  31.05 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0503  MSHA biogenesis protein MshJ  30.45 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3770  MSHA biogenesis protein MshJ  29.55 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3837  MSHA biogenesis protein MshJ  30.45 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3349  MSHA biogenesis protein MshJ  32.31 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002366  MSHA biogenesis protein MshJ  31.13 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0506  MSHA biogenesis protein MshJ  30 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1133  hypothetical protein  30.04 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0346936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0168  MSHA biogenesis protein MshJ  30.62 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0558  MSHA biogenesis protein MshJ  29.86 
 
 		 216 aa  98.6  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4419  MSHA biogenesis protein MshJ  29.09 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2818  MSHA biogenesis protein MshJ  34.76 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0482  MSHA biogenesis protein MshJ  28.77 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3488  MSHA biogenesis protein MshJ  30.97 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3665  MSHA biogenesis protein MshJ  29.87 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0464  MSHA biogenesis protein MshJ  30.57 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0542  MSHA biogenesis protein MshJ  31.85 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3753  MSHA biogenesis protein MshJ  28.05 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3276  MSHA biogenesis protein MshJ  34.54 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114  MSHA biogenesis protein MshJ  33.1 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3094  MshA biogenesis protein, MshJ-like protein  32.44 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0452  MSHA biogenesis protein MshJ  29.53 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0762  hypothetical protein  26.48 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00540771  normal  0.362126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00249  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshJ (pilus type IV)  28.97 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3334  hypothetical protein  24.62 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>