39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1990 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1990  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  100 
 
 		 194 aa  386  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2231  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  85.34 
 
 		 191 aa  337  8e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.569395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0922  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  83.24 
 
 		 195 aa  329  2e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.188149 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0897  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  86.19 
 
 		 191 aa  329  2e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.762651  normal  0.613497 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1136  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  48.19 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.418303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1391  DNA-directed RNA polymerase  41.3 
 
 		 180 aa  137  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  43.08 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1425  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  38.25 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2241  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  41.24 
 
 		 176 aa  134  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.270125  hitchhiker  0.00212612 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1437  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  39.11 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.194518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0471  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.99 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1197  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.99 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1235  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.68 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  36.17 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0658  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  33.33 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1321  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  37.91 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0285  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  31.55 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2863  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.65 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00140863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0245  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.79 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2242  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  33.52 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0568  DNA-directed RNA polymerase  37.11 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.686614  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2280  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.99 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000121827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0603  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  32.79 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1488  DNA-directed RNA polymerase  34.38 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.462584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3454  DNA-directed RNA polymerase  34.22 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0728  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  33.16 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2207  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  31.94 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2396  DNA-directed RNA polymerase subunit E'  28.72 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34242  subunit of RNA polymerase III  27.33 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_006686  CND04750  conserved hypothetical protein  32.52 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551706  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15619  predicted protein  25.82 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19835  predicted protein  29.03 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.241408  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01447  DNA-directed RNA polymerase III subunit 22.9 kDa, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04350)  26.8 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28240  RNA polymerase II subunit  26.09 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.18212  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01580  hypothetical protein  29.47 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35680  predicted protein  27.66 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37948  predicted protein  25.32 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0428372  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01521  RNA polymerase II subunit 7 (AFU_orthologue; AFUA_8G05300)  23.53 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  29.69 
 
 		 757 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>