More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1854 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1854  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
472 aa  955    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1635  CoA-binding domain-containing protein  80.09 
 
 
461 aa  762    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.242255  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1804  CoA-binding domain-containing protein  79.65 
 
 
461 aa  766    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.688194  normal  0.0833486 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0484  CoA-binding domain-containing protein  82.9 
 
 
461 aa  799    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.833675  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1093  CoA-binding domain-containing protein  61.56 
 
 
477 aa  588  1e-167  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0290  CoA-binding domain-containing protein  50.11 
 
 
461 aa  441  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.388357  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0977  CoA-binding domain-containing protein  49.42 
 
 
484 aa  392  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000724597 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  41.51 
 
 
704 aa  333  4e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  43.7 
 
 
508 aa  323  3e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  38.25 
 
 
714 aa  318  1e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.81 
 
 
699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  36.42 
 
 
706 aa  303  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  36.89 
 
 
706 aa  301  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2897  CoA-binding domain-containing protein  36.76 
 
 
451 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
702 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1589  CoA-binding domain-containing protein  36.87 
 
 
451 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  35.31 
 
 
703 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  35.68 
 
 
702 aa  289  7e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0319  CoA-binding domain protein  38.74 
 
 
464 aa  289  8e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.7 
 
 
696 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  34.99 
 
 
696 aa  287  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  37.12 
 
 
929 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  37.04 
 
 
700 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  38.12 
 
 
921 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  35.84 
 
 
697 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1471  CoA-binding  34.72 
 
 
687 aa  277  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2327  CoA-binding domain-containing protein  35.28 
 
 
707 aa  277  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
660 aa  276  8e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  36.13 
 
 
697 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  36.98 
 
 
698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  38.43 
 
 
711 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  35.65 
 
 
695 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  37.12 
 
 
883 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  36.15 
 
 
701 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  35.91 
 
 
709 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  35.27 
 
 
712 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  37.39 
 
 
918 aa  269  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  35.46 
 
 
669 aa  269  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  34.83 
 
 
892 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  34.88 
 
 
920 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0554  CoA-binding domain-containing protein  34.85 
 
 
689 aa  268  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.794682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4122  CoA-binding domain protein  35.96 
 
 
719 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  34.98 
 
 
722 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  36.52 
 
 
911 aa  267  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  32.7 
 
 
915 aa  266  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.48 
 
 
892 aa  266  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1620  CoA-binding domain-containing protein  35.48 
 
 
694 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0696581 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  34.6 
 
 
660 aa  262  8e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  35.28 
 
 
889 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  33.91 
 
 
698 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
907 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.1 
 
 
711 aa  256  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  33.62 
 
 
897 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  33.4 
 
 
722 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  32.69 
 
 
905 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  34.61 
 
 
907 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  33.77 
 
 
688 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  33.64 
 
 
680 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.55 
 
 
699 aa  252  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
899 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  36.07 
 
 
707 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1703  CoA-binding domain-containing protein  33.11 
 
 
680 aa  250  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  34.87 
 
 
698 aa  250  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 
907 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  34.49 
 
 
912 aa  249  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  34.33 
 
 
713 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  36.13 
 
 
698 aa  246  6e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  31.03 
 
 
705 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.71 
 
 
900 aa  244  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
897 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  32.97 
 
 
895 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  33.26 
 
 
707 aa  232  9e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  33.89 
 
 
893 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0138  CoA-binding domain-containing protein  31.22 
 
 
492 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0892765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  32.18 
 
 
704 aa  229  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
893 aa  229  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  34.13 
 
 
709 aa  228  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0914  CoA-binding domain-containing protein  32.31 
 
 
687 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.216851  hitchhiker  0.00000000145434 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  35.84 
 
 
693 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  33.12 
 
 
893 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  34.13 
 
 
699 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0978  CoA-binding domain-containing protein  34.93 
 
 
375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00209366  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  33.41 
 
 
699 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.66 
 
 
903 aa  221  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  34.98 
 
 
693 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  33.69 
 
 
897 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  33.76 
 
 
728 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.33 
 
 
692 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3442  CoA-binding domain protein  31.24 
 
 
710 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2428  CoA-binding domain protein  31.82 
 
 
697 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.816008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  35.41 
 
 
926 aa  217  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0162  CoA-binding domain-containing protein  35.42 
 
 
516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  33.61 
 
 
926 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  35.31 
 
 
911 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  31.12 
 
 
913 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  31.49 
 
 
911 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  31.32 
 
 
904 aa  210  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1246  CoA-binding domain-containing protein  30.85 
 
 
753 aa  209  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000185124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  35.98 
 
 
904 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  32.2 
 
 
887 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>