54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1812 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1812  THUMP domain-containing protein  100 
 
 		 360 aa  710    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1622  THUMP domain-containing protein  78.09 
 
 		 364 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.92065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1655  THUMP domain-containing protein  77.65 
 
 		 359 aa  558  1e-158  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.57853  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0539  THUMP domain-containing protein  75 
 
 		 362 aa  551  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0117648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1772  THUMP domain-containing protein  41.71 
 
 		 369 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.375193  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  44 
 
 		 416 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  38.57 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.85 
 
 		 482 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  40 
 
 		 474 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0341  THUMP domain-containing protein  34.29 
 
 		 184 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1311  THUMP domain-containing protein  35.51 
 
 		 177 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1164  THUMP domain-containing protein  39.02 
 
 		 175 aa  49.7  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.91 
 
 		 484 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.47 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  44.3 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1784  THUMP domain-containing protein  35.45 
 
 		 174 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.386874 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.52 
 
 		 482 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.65 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.65 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  37.65 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.65 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.65 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.65 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.65 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.65 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.65 
 
 		 482 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.36 
 
 		 472 aa  47  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.76 
 
 		 383 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.52 
 
 		 482 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.52 
 
 		 482 aa  46.2  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  42.86 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.9 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.76 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.71 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.76 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.71 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.94 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.71 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.71 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.18 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.66 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.59 
 
 		 484 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.29 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.29 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.29 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.29 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.29 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.25 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  29.66 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 484 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.95 
 
 		 465 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 482 aa  42.7  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.74 
 
 		 484 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>