More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2040 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  60.69 
 
 		 611 aa  776    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  54.98 
 
 		 602 aa  686    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  54.65 
 
 		 602 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  54.06 
 
 		 609 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  54.98 
 
 		 600 aa  681    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  53.55 
 
 		 606 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  55.15 
 
 		 602 aa  677    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  54.65 
 
 		 602 aa  673    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 616 aa  1283    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  52.57 
 
 		 623 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  55.15 
 
 		 602 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  55.15 
 
 		 602 aa  685    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  53.97 
 
 		 610 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  55.15 
 
 		 602 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  66.56 
 
 		 624 aa  860    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  54.65 
 
 		 602 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  55.34 
 
 		 606 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  59.9 
 
 		 613 aa  743    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  54.65 
 
 		 602 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  54.61 
 
 		 611 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.03 
 
 		 746 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  36.42 
 
 		 774 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.83 
 
 		 584 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  25.78 
 
 		 621 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 		 985 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  22.87 
 
 		 891 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1579  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 		 766 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  28.93 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25 
 
 		 627 aa  67.8  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  25.68 
 
 		 662 aa  67.8  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 		 651 aa  67  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 		 882 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  24.32 
 
 		 623 aa  67  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1274  serine/threonine protein kinase  22.35 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  23.21 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3751  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000729349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  28.07 
 
 		 1358 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 894 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  25.79 
 
 		 604 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2237  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2291  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.76151  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  25.63 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  25.61 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  27.68 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 652 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  25.21 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.19 
 
 		 668 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1260  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  22.07 
 
 		 625 aa  63.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  26.18 
 
 		 586 aa  63.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.15 
 
 		 641 aa  63.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5424  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178925  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  25.76 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 		 651 aa  62.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.98 
 
 		 747 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  26.67 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.11 
 
 		 653 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25 
 
 		 662 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  27.85 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  23.98 
 
 		 626 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.91 
 
 		 822 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 414 aa  62  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.64 
 
 		 664 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  24.67 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  23.53 
 
 		 472 aa  62  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  27.36 
 
 		 537 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  28.92 
 
 		 637 aa  61.6  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 		 608 aa  61.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  27.52 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.33 
 
 		 653 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  27.52 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1700  Serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0154574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0341  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0204  serine/threonine protein kinase  24.84 
 
 		 679 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.998646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  21.97 
 
 		 692 aa  60.8  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  25.68 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  28.77 
 
 		 626 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.48 
 
 		 636 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3384  Serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.904774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  25.21 
 
 		 915 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  23.96 
 
 		 604 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>