60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1729 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 122 aa  246  9e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  86.89 
 
 		 122 aa  221  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  86.89 
 
 		 128 aa  221  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  86.89 
 
 		 123 aa  203  6e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  58.54 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  56.9 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  52.17 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  52.17 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  52.17 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  52.1 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  50.43 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 		 116 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  47.79 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  47.01 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  45.61 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  46.36 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  40.71 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  45.61 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  44.55 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  44.74 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  38.98 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  41.59 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  39.82 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  38.74 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  41.12 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.794069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  43.52 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  41.44 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  41.82 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  45.05 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.75 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  37.39 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  34.69 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  37.84 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  38.96 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  39.47 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  38.67 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  36.36 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  36.36 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  36.36 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  38.67 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  38.96 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  40.58 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  37.66 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  36.36 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  36.36 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  40 
 
 		 111 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  36.99 
 
 		 101 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  34.25 
 
 		 106 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  36.36 
 
 		 106 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  40.85 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  36.84 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  38.89 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  36 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  31.87 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  35.63 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  33.33 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  38.36 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  34.21 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  38.36 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  33.33 
 
 		 123 aa  40  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>