40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0244 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 131 aa  253  6e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  53.54 
 
 		 128 aa  123  9e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  52.1 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  54.62 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  53.39 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  50.42 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  50.89 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  48.25 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  48.25 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  47.37 
 
 		 119 aa  105  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  51.26 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  46.49 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  53.12 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  48.28 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  48.28 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  46.09 
 
 		 116 aa  95.9  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  45.61 
 
 		 118 aa  95.9  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  45.22 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  50.86 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  44.35 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  45.61 
 
 		 125 aa  94  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  48.54 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  47.27 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.794069 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  41.32 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  42.98 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  40.87 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  46.96 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  45.69 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  45.19 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  39.25 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.42 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  41.24 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  38.16 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  40.79 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  39.47 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0685  50S ribosomal protein L24  31.65 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1563  ribosomal protein L24  33.33 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00170276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  35.8 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>