40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1395 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 119 aa  244  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  80.67 
 
 		 119 aa  200  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  79.49 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  77.97 
 
 		 119 aa  197  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  77.97 
 
 		 119 aa  197  6e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  56.9 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  53.39 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  56.03 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  56.25 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  54.31 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  53.78 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  52.78 
 
 		 116 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  48.67 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  51.33 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  49.56 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  50.88 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  50.46 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  43.52 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  46.96 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  44.44 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.794069 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  44.04 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  44.66 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  43.52 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  42.59 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  42.59 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  40 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.75 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  36.11 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  36.89 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  37.84 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  34.78 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  37.5 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  34.48 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  37.35 
 
 		 108 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  39.51 
 
 		 117 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  33.73 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  33.33 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  39.71 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>