33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0221 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  100 
 
 
125 aa  246  8e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  92.37 
 
 
118 aa  217  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  67.5 
 
 
120 aa  167  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  70.43 
 
 
119 aa  157  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  67.24 
 
 
118 aa  150  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.794069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  54.39 
 
 
116 aa  123  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  55.17 
 
 
120 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  57.27 
 
 
116 aa  120  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  53.85 
 
 
121 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  51.75 
 
 
117 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  46.55 
 
 
121 aa  102  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  51.33 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  40.32 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  49.12 
 
 
121 aa  95.9  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  45.61 
 
 
131 aa  94  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  45.37 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  45.37 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  44.44 
 
 
119 aa  90.5  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  44.44 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  41.23 
 
 
119 aa  89.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  42.59 
 
 
119 aa  89  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  39.84 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  42.48 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  39.82 
 
 
122 aa  84  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  38.05 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  37.17 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  34.51 
 
 
168 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  35.29 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  35.19 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  43.18 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  35.56 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  34.44 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.53 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>