33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0575 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 
121 aa  244  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  70.59 
 
 
120 aa  168  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  69.75 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  62.18 
 
 
121 aa  155  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  64.1 
 
 
121 aa  150  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  64.29 
 
 
116 aa  141  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  57.89 
 
 
116 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  56.41 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  54.7 
 
 
118 aa  120  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  53.85 
 
 
125 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  54.87 
 
 
119 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  54.87 
 
 
119 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  53.98 
 
 
119 aa  117  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  53.1 
 
 
118 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.794069 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  53.1 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  51.33 
 
 
119 aa  110  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  48.67 
 
 
120 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  47.79 
 
 
119 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  48.25 
 
 
156 aa  103  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  48.28 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  46.36 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  46.43 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  46.36 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  44.74 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  46.3 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  42.73 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  44.17 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  37.17 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  38.38 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.97 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  38.98 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  43.18 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  36.79 
 
 
115 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>