33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2229 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  100 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  92.37 
 
 		 125 aa  217  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  71.3 
 
 		 120 aa  168  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  72.17 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  68.64 
 
 		 118 aa  154  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.794069 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  56.9 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  53.51 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  56.36 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  54.7 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  50.88 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  48.67 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  51.33 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  49.12 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  45.61 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  46.3 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  45.37 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  46.3 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  42.11 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  45.37 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  39.83 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  43.52 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  44.25 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  41.59 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  41.59 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  39.82 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  36.28 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  37.17 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  43.18 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  35.19 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  34.95 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  32.73 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  32.11 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.1 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>