47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0102 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  225  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  64.77 
 
 		 119 aa  120  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  53.12 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  41.67 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  47.31 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  44.09 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  45.16 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  45.05 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  46.67 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  44.44 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  45.56 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  40.78 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  46.15 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  43.18 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  45.65 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  43.18 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  40.45 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  40.45 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  47.25 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  43.48 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  42.35 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.794069 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  39.33 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.94 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  44.44 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  40.21 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  40.7 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  43.18 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  33.33 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  37.89 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  38.82 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  38.82 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  34.78 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  38.37 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1922  50S ribosomal protein L24  51.35 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.836798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  39.58 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  32.05 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  32.05 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  37.5 
 
 		 80 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1957  ribosomal protein L24  43.59 
 
 		 78 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  30.12 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  32.05 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  36.73 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0070  50S ribosomal protein L24  41.03 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.033879  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  47.37 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  32.2 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>