51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0655 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 119 aa  243  9e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 119 aa  243  9e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  99.16 
 
 		 119 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  88.03 
 
 		 119 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  77.97 
 
 		 119 aa  197  6e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  61.82 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  56.48 
 
 		 116 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  52.17 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  55.75 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  51.3 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  51.3 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  54.87 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  50 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  50.44 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  49.57 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  48.25 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  52.63 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  50.43 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  52.78 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  47.22 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.794069 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  46.79 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  42.59 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  46.3 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  45.37 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  42.59 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  40.38 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  37.04 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  40.62 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.14 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  40.45 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  38.46 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  39.51 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  41.56 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0409  ribosomal protein L24  36.76 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  41.43 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  41.43 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  42.65 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  42.65 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  40.48 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  37.66 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  43.9 
 
 		 117 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1840  50S ribosomal protein L24  40.26 
 
 		 80 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0647015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  34.94 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0300  50S ribosomal protein L24  40.26 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  41.18 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  38.03 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  36.36 
 
 		 104 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>