53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1748 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 128 aa  256  7e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  89.34 
 
 		 122 aa  222  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  86.89 
 
 		 122 aa  221  3e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  85.25 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  55.81 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  54.31 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  53.54 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  51.3 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  51.3 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  51.3 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  49.57 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  49.12 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  47.58 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  49.15 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  46.49 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  46.36 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  41.59 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  44.74 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  45.45 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  38.98 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.477291 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  40.5 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  39.84 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  41.59 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  41.12 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.794069 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  37.84 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  45.37 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  43.64 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  39.32 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  45.16 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  39.13 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  35.71 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.04 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  36.94 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  38.96 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  38.96 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  38.96 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  38.96 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  40.26 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  40.26 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  40.26 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  37.66 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  38.16 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  36.99 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  36.36 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  39.13 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  37.33 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  37.33 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  38.36 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  38.36 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  34.67 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  32.88 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2053  50S ribosomal protein L24  34.78 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000596769  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  36.36 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>