33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0543 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 121 aa  240  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  68.07 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  62.18 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  63.33 
 
 		 120 aa  153  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  56.41 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  58.33 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  57.14 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  56.48 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  50.43 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  49.57 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  50.43 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  49.57 
 
 		 119 aa  104  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  47.37 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  49.12 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  46.96 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  50.86 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  49.12 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  46.43 
 
 		 118 aa  94.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.794069 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  49.11 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  44.64 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  45.37 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  41.96 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  43.52 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  44.44 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  43.97 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  42.99 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  39.32 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  42.59 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.78 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  47.25 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  37.29 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  38.89 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  34.78 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>