265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1210 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  100 
 
 
75 aa  149  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  77.33 
 
 
75 aa  122  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  56 
 
 
80 aa  87.8  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  50.67 
 
 
80 aa  84  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  50.67 
 
 
80 aa  84  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  47.95 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  43.06 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  50 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  46.48 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  36.11 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  43.66 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  36.11 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  36.11 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  39.13 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  36.11 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  38.03 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  45.31 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  36.23 
 
 
78 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  50 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  44.83 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  43.06 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  39.44 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  42.25 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  39.44 
 
 
201 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  36.62 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  36.11 
 
 
81 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  47.17 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  38.36 
 
 
76 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  47.54 
 
 
110 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  37.14 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  39.44 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  37.68 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  42.25 
 
 
78 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  38.03 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  39.13 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  46.81 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  43.4 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  38.03 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  40 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  47.17 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  39.13 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  39.71 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  37.68 
 
 
77 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  40 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  38.36 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  38.81 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  38.57 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  42.42 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  33.8 
 
 
81 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1404  SirA family protein  37.68 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0684683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  36.67 
 
 
186 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.14 
 
 
189 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  36.67 
 
 
186 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  40 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  53.9  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  34.72 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  37.68 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  37.68 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  38.03 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  38.18 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  37.1 
 
 
76 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  37.68 
 
 
76 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  42.86 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  38.36 
 
 
200 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  39.68 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  39.13 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  31.88 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  38.24 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  39.44 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  36.62 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  28.57 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  41.51 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  30.43 
 
 
75 aa  52  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  31.88 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  36.62 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  36.11 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  34.78 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>