More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0120 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0120  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
338 aa  679    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0089  histidinol phosphate aminotransferase  78.25 
 
 
333 aa  492  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00200797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1168  aminotransferase, class I and II  63.32 
 
 
321 aa  414  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.376833  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1942  histidinol phosphate aminotransferase  35.14 
 
 
391 aa  159  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.95238 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1656  histidinol-phosphate aminotransferase  30.12 
 
 
376 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.532506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32 
 
 
351 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.53 
 
 
366 aa  143  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  34.15 
 
 
370 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  31.21 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 
358 aa  133  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
371 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.99 
 
 
358 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  28 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  30.12 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  31.83 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  31.63 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 
350 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
355 aa  125  9e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  31.21 
 
 
352 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 
348 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
352 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  28.44 
 
 
353 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 
353 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 
357 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  29.31 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  29.33 
 
 
356 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  30.24 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 
373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  30.88 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  29.39 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  30.42 
 
 
348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.97 
 
 
358 aa  119  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  31.46 
 
 
357 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  32.92 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  31.66 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  31.85 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 
350 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  30.03 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 
357 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  31.63 
 
 
353 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  31.18 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  30.03 
 
 
364 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  25.97 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1710  histidinol-phosphate aminotransferase  30.43 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  28.83 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  30.59 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  31 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  32.13 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  29.79 
 
 
357 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  32.1 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 
348 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  30.37 
 
 
348 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  27.83 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 
365 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  31.04 
 
 
367 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  27.83 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  31.2 
 
 
370 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 
360 aa  112  8.000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  30.67 
 
 
356 aa  112  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  29.68 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  29.79 
 
 
356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  30.31 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  32.75 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  30.69 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  28.95 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 
362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  29.66 
 
 
350 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 
370 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1012  histidinol phosphate aminotransferase  28.45 
 
 
356 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723593  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  28.88 
 
 
370 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  31.45 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2375  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  32.23 
 
 
356 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  32.23 
 
 
356 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 
367 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  33.02 
 
 
363 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.44 
 
 
370 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  29.68 
 
 
377 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  32 
 
 
356 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  28.23 
 
 
370 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4228  aminotransferase class I and II  33.13 
 
 
347 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  28.23 
 
 
370 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  29.05 
 
 
395 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  30.53 
 
 
382 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.14 
 
 
370 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  32 
 
 
356 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>