More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2031 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  78.98 
 
 
434 aa  728    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  78.72 
 
 
434 aa  708    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  81.75 
 
 
434 aa  732    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
435 aa  897    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  85.75 
 
 
429 aa  780    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  81.31 
 
 
434 aa  738    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  80.37 
 
 
434 aa  744    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  61.43 
 
 
433 aa  544  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  51.54 
 
 
427 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  53.22 
 
 
431 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  51.79 
 
 
430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 
430 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 
428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  51.07 
 
 
447 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  51.07 
 
 
447 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  50.6 
 
 
437 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 
426 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  50.84 
 
 
430 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  49.4 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  51.44 
 
 
430 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  51.55 
 
 
431 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50.48 
 
 
431 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 
442 aa  435  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
434 aa  437  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 
427 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  50.96 
 
 
430 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 
432 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  50.72 
 
 
430 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  50.72 
 
 
430 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  50.48 
 
 
427 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  50.6 
 
 
430 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 
432 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  51.2 
 
 
429 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
428 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  50.95 
 
 
427 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  50.72 
 
 
431 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 
439 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  50.96 
 
 
430 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  50.47 
 
 
430 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  50.96 
 
 
430 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  50.6 
 
 
430 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  51.43 
 
 
427 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  49.16 
 
 
444 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1839  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 
437 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  49.16 
 
 
447 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05641  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 
437 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.622975 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
451 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 
437 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  51.19 
 
 
427 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
436 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
431 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
436 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  47.75 
 
 
429 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
436 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  51.4 
 
 
437 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 
432 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
427 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
426 aa  425  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
427 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  50.48 
 
 
427 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
427 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
428 aa  428  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
431 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
431 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
428 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
428 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
435 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
431 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  48.93 
 
 
449 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 
428 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 
439 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
436 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  52.14 
 
 
427 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
435 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
431 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
429 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
442 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
430 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 
439 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
429 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 
430 aa  418  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  48.81 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  46.45 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  48.61 
 
 
438 aa  415  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 
431 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 
432 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  48.56 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  48.81 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  48.46 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  49.29 
 
 
807 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
432 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  47.52 
 
 
431 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>