More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1246 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1246  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
393 aa  800    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404887  normal  0.363683 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1485  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.63 
 
 
407 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.593755  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1273  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.57 
 
 
397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.47 
 
 
396 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.33 
 
 
383 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0888  alcohol dehydrogenase, iron-containing  53.28 
 
 
402 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.867893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.97 
 
 
395 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1767  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 
395 aa  299  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000492004  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
414 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
395 aa  225  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.32 
 
 
390 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0717  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
422 aa  199  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003761  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
414 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0152546  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0140  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 
399 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02634  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
414 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0492  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
384 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.28 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.54 
 
 
400 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.54 
 
 
400 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
400 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.75 
 
 
400 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
384 aa  172  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  32.44 
 
 
392 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.07 
 
 
400 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
395 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0534  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
378 aa  169  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.0000192772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
398 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2617  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
377 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465254  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0253  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1319  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2661  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.01 
 
 
400 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
399 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
395 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24600  predicted protein  32.81 
 
 
413 aa  160  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366572  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  31.82 
 
 
382 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.82 
 
 
382 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.36 
 
 
384 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.06 
 
 
390 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
400 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
391 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0611  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.63 
 
 
375 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1199  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
380 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  34.69 
 
 
387 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
390 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
381 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  32.53 
 
 
383 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  31.16 
 
 
382 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  31.16 
 
 
382 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
383 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
392 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.78 
 
 
376 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1265  NADPH-dependent butanol dehydrogenase  30.98 
 
 
388 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00856884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
385 aa  149  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1465  NADPH-dependent butanol dehydrogenase  31.25 
 
 
388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  31.27 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
382 aa  146  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1164  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.18 
 
 
379 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144236  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
887 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  33.86 
 
 
395 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
395 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.38 
 
 
387 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
387 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
382 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
388 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  33.86 
 
 
395 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
388 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  33.86 
 
 
395 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  33.86 
 
 
395 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  33.86 
 
 
395 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
395 aa  143  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  30.65 
 
 
381 aa  143  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  30.56 
 
 
383 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 
387 aa  143  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02531  hypothetical protein  33.57 
 
 
397 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
393 aa  142  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3674  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
887 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  33.86 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.83 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0629  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
872 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  28.29 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0904  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  30.05 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  30.83 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  31.91 
 
 
382 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>