More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1767 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1767  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 395 aa  785    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000492004  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  64.05 
 
 		 395 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.74 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1485  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.33 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.593755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.78 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1246  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 		 393 aa  299  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404887  normal  0.363683 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1273  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.5 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.59 
 
 		 395 aa  296  6e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.46 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0888  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.8 
 
 		 402 aa  272  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.867893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2617  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0492  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0253  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1319  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2661  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 		 380 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0534  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.25 
 
 		 378 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.0000192772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0140  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1199  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24600  predicted protein  33.17 
 
 		 413 aa  182  7e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0599  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.155589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02634  alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003761  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0152546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0717  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 422 aa  176  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 		 395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 		 398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.11 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.55 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.83 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.83 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 		 388 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31 
 
 		 386 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.4 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.4 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.33 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  32.33 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.42 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 		 387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 		 387 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.68 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.18 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 		 393 aa  149  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.35 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.35 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.13 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 		 872 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3303  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 		 383 aa  146  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1428  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 		 441 aa  146  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 380 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  29.27 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 		 387 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0499  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 		 401 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1042  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  30.29 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>