More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0253 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0253  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 384 aa  752    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.3 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24600  predicted protein  44.94 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0492  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.52 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02634  alcohol dehydrogenase  42.44 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0717  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 		 422 aa  291  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003761  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0152546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.7 
 
 		 414 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0534  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 		 378 aa  266  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.0000192772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1767  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.12 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000492004  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2617  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1319  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.95 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2661  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.95 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.99 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.99 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.74 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.74 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 		 400 aa  215  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1199  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.35 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.01 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.01 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.04 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1485  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 		 407 aa  206  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.593755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1273  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 397 aa  202  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  36.98 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 396 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.72 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.46 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.58 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1246  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 393 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404887  normal  0.363683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.67 
 
 		 384 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0888  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.29 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.867893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.17 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  33.17 
 
 		 382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.56 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 		 382 aa  190  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  32.63 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  33.25 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 		 382 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 		 382 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.26 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  35.29 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  34.01 
 
 		 382 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 		 382 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 382 aa  186  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 		 383 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 		 382 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.32 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.68 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 		 390 aa  183  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 		 383 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  35.42 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  34.55 
 
 		 386 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.09 
 
 		 393 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  37.65 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>