More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04258 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 372 aa  730    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  80.86 
 
 		 370 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  76.75 
 
 		 373 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  77.36 
 
 		 353 aa  549  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3449  rod shape-determining protein RodA  68.93 
 
 		 359 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.704503  normal  0.518188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  51.78 
 
 		 383 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  48.57 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  50.86 
 
 		 376 aa  328  9e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  48.62 
 
 		 380 aa  325  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  47.88 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  49.4 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  46.09 
 
 		 374 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  44.86 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  47.29 
 
 		 368 aa  315  7e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  48.06 
 
 		 377 aa  315  9e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  49.11 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  48.22 
 
 		 368 aa  311  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  46.44 
 
 		 368 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  46.72 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  47.01 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  50.44 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  45.94 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  46.44 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  46.44 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  47.98 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  46.44 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  46.44 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  46.44 
 
 		 368 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  48.22 
 
 		 368 aa  305  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  46.15 
 
 		 368 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  47.48 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  46.93 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  44.73 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  46.22 
 
 		 373 aa  299  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  48.47 
 
 		 361 aa  298  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  46.86 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  48.32 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  47.35 
 
 		 373 aa  292  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  48.66 
 
 		 381 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  46.63 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  46.72 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  48.66 
 
 		 381 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  46.61 
 
 		 368 aa  289  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  44.94 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  44.66 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  42.18 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  45.87 
 
 		 381 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  47.93 
 
 		 380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  45.75 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  49.55 
 
 		 382 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  45.82 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  43.45 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  45.32 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  48.95 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01655  rod shape-determining protein RodA  53.23 
 
 		 253 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  41.62 
 
 		 372 aa  282  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  42.56 
 
 		 362 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  46.18 
 
 		 370 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  47.16 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  45.57 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  45.57 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  45.57 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  45.57 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  45.57 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  45.87 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  45.87 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  45.87 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  45.87 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  45.87 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  45.87 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  45.87 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  45.87 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  45.13 
 
 		 364 aa  279  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4681  rod shape-determining protein RodA  47.16 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4806  rod shape-determining protein RodA  47.16 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  0.152125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  44.07 
 
 		 370 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  44.07 
 
 		 370 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  44.07 
 
 		 370 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  46.18 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1107  rod shape-determining protein  48.21 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  48.21 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  47.09 
 
 		 370 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  42.39 
 
 		 370 aa  268  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  51.12 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  40.56 
 
 		 403 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  40.56 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  39.04 
 
 		 360 aa  262  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  43.38 
 
 		 366 aa  255  9e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  39.08 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  43.33 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  41.6 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  41.42 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  40.9 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0236  cell wall shape-determining protein  46.58 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1742  rod shape-determining protein RodA  42.03 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  38.42 
 
 		 360 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  42.56 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  42.2 
 
 		 382 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  41.83 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  41.94 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>