38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01399 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01399  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumI  100 
 
 		 349 aa  707    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.490868  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  41.93 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0743  putative glycosyl transferase  44.38 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136224  hitchhiker  0.00617937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 375 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  27.89 
 
 		 364 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4490  hypothetical protein  29.36 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  22 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3140  zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  27.72 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0299032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  30.15 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  27.88 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3496  Zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  26.92 
 
 		 503 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 		 381 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 426 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 761 aa  46.6  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 358 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>