145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0941 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  100 
 
 
401 aa  824    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  91.77 
 
 
389 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  67.82 
 
 
402 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  47.15 
 
 
394 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  47.15 
 
 
394 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  47.15 
 
 
394 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  46.27 
 
 
385 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  47.15 
 
 
384 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  44.63 
 
 
419 aa  339  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  43.33 
 
 
412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  43.09 
 
 
427 aa  325  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  43.6 
 
 
418 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  41.58 
 
 
432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  42.97 
 
 
404 aa  259  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  35.66 
 
 
370 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  38.44 
 
 
401 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  47.69 
 
 
225 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  48.29 
 
 
244 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  48.57 
 
 
226 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  45.71 
 
 
233 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  47.81 
 
 
245 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  38.69 
 
 
232 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  27.91 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  27.91 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  35.61 
 
 
233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  28.47 
 
 
401 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  37.7 
 
 
289 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  37.87 
 
 
191 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  36.36 
 
 
528 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  41.33 
 
 
191 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  37.5 
 
 
192 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  38.5 
 
 
449 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  36.69 
 
 
191 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  36.69 
 
 
191 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  32.9 
 
 
191 aa  96.3  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  35.53 
 
 
191 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  40.82 
 
 
689 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  34.19 
 
 
191 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2572  hypothetical protein  27.93 
 
 
398 aa  92.8  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376371  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  36.13 
 
 
191 aa  92  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  38.71 
 
 
192 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  37.33 
 
 
191 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  33.77 
 
 
191 aa  90.1  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  34.38 
 
 
194 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  36.47 
 
 
338 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  34.62 
 
 
192 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  34.62 
 
 
192 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  34.62 
 
 
192 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  33.96 
 
 
194 aa  87  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  33.96 
 
 
196 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  37.42 
 
 
192 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  33.96 
 
 
194 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  34.87 
 
 
186 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  36.31 
 
 
192 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  36 
 
 
191 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  33.33 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  33.33 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  33.33 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  34.13 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  34.84 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  35.09 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  33.33 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  33.33 
 
 
194 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  33.33 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  34.32 
 
 
437 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  34.59 
 
 
560 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  33.55 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  36.84 
 
 
317 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  33.33 
 
 
194 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  29.68 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  35.06 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  31.82 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  32.79 
 
 
722 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  30.48 
 
 
191 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  30.48 
 
 
191 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  30.48 
 
 
191 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  30.46 
 
 
192 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  33.55 
 
 
191 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  33.93 
 
 
493 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  33.55 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  32.26 
 
 
191 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  31.49 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  29.28 
 
 
191 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  32.47 
 
 
192 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  31.58 
 
 
192 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4448  stress protein  28.92 
 
 
675 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  30.97 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  35.71 
 
 
191 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  30.92 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  32.47 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  32.03 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  28.95 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  29.03 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  30.72 
 
 
191 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  32.28 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  29.68 
 
 
191 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  29.11 
 
 
192 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  28.19 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  31.65 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  31.65 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>