29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5237 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Replicon accession
Locus tag
Product
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  79.39 
 
 		 172 aa  258  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  60 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  57.3 
 
 		 187 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  56.5 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  54.14 
 
 		 187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  56.42 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  53.93 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  47.49 
 
 		 184 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  43.24 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
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NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  43.82 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  45.62 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 181 aa  124  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
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NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  31.84 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  33.52 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
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NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
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NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  32.21 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 229 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
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