19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4404 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4404  adhesin 20K  100 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  60 
 
 		 329 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  56 
 
 		 228 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  49 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  45.1 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  46.46 
 
 		 336 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  45.1 
 
 		 396 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  46 
 
 		 311 aa  77.8  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  45.36 
 
 		 338 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  44.33 
 
 		 340 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  44.44 
 
 		 360 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  37.62 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  37.62 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  37.62 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  36.17 
 
 		 380 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  38.82 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  38.3 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  38.3 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  38.3 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>