56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1969 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1969  O-antigen chain length regulator  100 
 
 		 349 aa  696    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23360  O-antigen chain length regulator  55.74 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000253152  hitchhiker  0.00753817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1368  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.97 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1674  lipopolysaccharide biosynthesis  27.65 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1205  chain length determinant protein  24.27 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.747059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1630  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1033  chain length determinant protein  23.46 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.205095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2307  chain length determinant protein  23.95 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0598886 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01929  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  23.46 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01915  hypothetical protein  23.46 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  24.79 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2960  chain length determinant protein  23.98 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000740001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2318  chain length determinant protein  23.46 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2639  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1615  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.626955  normal  0.791839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2258  chain length determinant protein  23.49 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0308231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2417  chain length determinant protein  23.65 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0117622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2305  chain length determinant protein  23.65 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0412425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2204  chain length determinant protein  23.35 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  50 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4136  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.93 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.93 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.813852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03612  hypothetical protein  22.93 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4149  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  23.2 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03663  Entobacterial Common Antigen (ECA) polysaccharide chain length modulation protein  22.93 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0114437  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0658934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4296  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.93 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4002  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.93 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  23.05 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4145  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  23.18 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4218  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.65 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00115149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4307  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  23.18 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4130  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  23.18 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4248  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  23.18 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4199  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.75 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0159  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  21.71 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2669  lipopolysaccharide biosynthesis  61.29 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  41.3 
 
 		 746 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0183  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  23.08 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  43.48 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0608  ferric enterobactin transport protein FepE  18.8 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  42 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.65 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4032  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  23.08 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.010328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  28.36 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0628  ferric enterobactin transport protein FepE  19.5 
 
 		 378 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.75 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0701  ferric enterobactin transport protein FepE  19.73 
 
 		 378 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0642  ferric enterobactin transport protein FepE  19.46 
 
 		 378 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.412553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0685  ferric enterobactin transport protein FepE  19.46 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.3 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2090  chain length determinant family protein  50 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00543  hypothetical protein  18.52 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.589908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00554  regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains  18.52 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22890  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.6 
 
 		 380 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0162  lipopolysaccharide biosynthesis protein WzzE  22.22 
 
 		 350 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>