41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1171 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  917    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  98.22 
 
 		 450 aa  903    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  52.46 
 
 		 457 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  47.38 
 
 		 480 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  45.01 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  44.1 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  43.21 
 
 		 450 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  43.21 
 
 		 449 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  40.44 
 
 		 439 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  42.32 
 
 		 449 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  42.54 
 
 		 449 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  39.91 
 
 		 439 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  39.51 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  40.18 
 
 		 441 aa  319  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  39.96 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  41.33 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  37.28 
 
 		 449 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  37.72 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  37.72 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  40.4 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  36.5 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  34.35 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  29.63 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  29.74 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  27.73 
 
 		 502 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  28.42 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  34.97 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  21.98 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  21.98 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  22.57 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  21.06 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  22.19 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  22.22 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  26.41 
 
 		 262 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  25.33 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  25.33 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  23.12 
 
 		 409 aa  46.6  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  20.69 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  22.83 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  22.63 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>