More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_51902 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_51902  maintenance of mitochondrial DNA  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  50.98 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  50.5 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  48.08 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  52.48 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  48.51 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  47 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  47.52 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  47.52 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  47.52 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  47.52 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  47.52 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  47.52 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  47.52 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  45.71 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  45.63 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  46.53 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  45.19 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  46.53 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  46.53 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  49 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 124 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  44.66 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  42.57 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  43.69 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  49 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  43.56 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  44.76 
 
 		 156 aa  87  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  42.16 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  42.16 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  44.66 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  40.19 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  42.16 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  42.45 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  41.35 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  40.19 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  41.58 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  39 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  41.84 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  41 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  37.25 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  43.69 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  43 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  38.83 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  39 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  43 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  39.6 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  42 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  39 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  37.14 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  34.29 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  37.14 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  37.14 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  37.14 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  39.22 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  37.14 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  37.14 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  37.14 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  37.14 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>