56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30484 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30484  predicted protein  100 
 
 		 200 aa  419  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0430346  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  36.87 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  35.86 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  39.41 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  34.83 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  36.26 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  34.5 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  30.81 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  30.1 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  30.46 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  29.44 
 
 		 199 aa  92  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  35.52 
 
 		 280 aa  91.3  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  30.81 
 
 		 341 aa  90.1  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  30.65 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  31.14 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  32.78 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  31.71 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160342 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  26.83 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  33.33 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  30.39 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04782  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  27.7 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.936481  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  26.82 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  30.59 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  28.16 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  30.46 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  24.86 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  29.94 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  23.78 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  26.4 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  27.88 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02880  Rho small monomeric GTPase, putative  30 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  30.95 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  27.91 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  26.04 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  26.11 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  27.04 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  26.88 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  28.24 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  24.74 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  22.53 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  28.66 
 
 		 161 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  27.5 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  21.39 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  23.12 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  26.35 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  23.64 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  28.57 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  27.35 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  24.2 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  22.84 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  27.86 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  27.68 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  26.47 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  24.86 
 
 		 317 aa  41.6  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  26.16 
 
 		 214 aa  41.2  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>