More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_50773 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_50773  phosphoribulokinase  100 
 
 		 396 aa  819    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45513  predicted protein  60.27 
 
 		 381 aa  459  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011186  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3931  phosphoribulokinase  56.73 
 
 		 332 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3980  phosphoribulokinase  56.73 
 
 		 332 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000234967  decreased coverage  0.00010781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5200  phosphoribulokinase  54.2 
 
 		 334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  1.4377100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  55.43 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3654  phosphoribulokinase  53.63 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  54.57 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4839  Phosphoribulokinase  53.3 
 
 		 333 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0781  phosphoribulokinase  52.72 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000028784  unclonable  0.0000000817454 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.91 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  40 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  36.53 
 
 		 343 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.96 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.89 
 
 		 323 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  31.31 
 
 		 313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  29.21 
 
 		 313 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1845  phosphoribulokinase  31.45 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0997041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.15 
 
 		 299 aa  143  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0113  phosphoribulokinase/uridine kinase  29.96 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.86 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1650  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.71 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00630764  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  33.18 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3252  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.71 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.570797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1993  phosphoribulokinase/uridine kinase  33.02 
 
 		 695 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0026662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0635  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.87 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.996805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2748  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.7 
 
 		 716 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  28.91 
 
 		 213 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  29.5 
 
 		 209 aa  94  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  32.16 
 
 		 209 aa  92.8  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  27.18 
 
 		 211 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  28.91 
 
 		 213 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  30.92 
 
 		 213 aa  90.1  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  30.88 
 
 		 213 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  29.47 
 
 		 213 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  30.88 
 
 		 213 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  30.88 
 
 		 213 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  27.8 
 
 		 212 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  28.57 
 
 		 212 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  29.38 
 
 		 218 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  28.22 
 
 		 204 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  29.21 
 
 		 213 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  29.52 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  29.05 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  30.92 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  28.71 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  29.13 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.62 
 
 		 205 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  28.99 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  28.5 
 
 		 202 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  27.01 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  35.9 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  29.47 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  35.9 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  30.43 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  29.95 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  26.96 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  27.59 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  27.96 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0970  uridine kinase  26.79 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0644  uridine kinase  34.15 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000687916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4462  uridine kinase  31.58 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4513  uridine kinase  31.58 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295414  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  27.09 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  29.33 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.54 
 
 		 217 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3093  uridine kinase  31.37 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0382  uridine kinase  35.32 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0215949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  26.96 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2023  uridine kinase  32.79 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4276  uridine kinase  30.97 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4113  uridine kinase  31.37 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4124  uridine kinase  31.37 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4460  uridine kinase  31.37 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0770159 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4608  uridine kinase  30.97 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  31.85 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  27.59 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2200  uridine kinase  27.54 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1606  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.85 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.397459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  27.49 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  27.18 
 
 		 211 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4227  uridine kinase  30.97 
 
 		 212 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  25.62 
 
 		 207 aa  76.3  0.000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  26.24 
 
 		 202 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1740  uridine kinase  31.97 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.627897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  26.54 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  26.54 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>