139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7107 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_7107  predicted protein  100 
 
 
129 aa  270  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  30.4 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  34.11 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  34.65 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  33.07 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  39.39 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  32.56 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  32.52 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  32.56 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  32.8 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  30.4 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  32.56 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  33.61 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  33.07 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  32 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  33.06 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  35.05 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  32 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  31.01 
 
 
173 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  36.36 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  36.36 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  31.2 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  31.5 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  32.35 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  36.22 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  32.8 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  32.32 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  33.67 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  33.67 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  34.58 
 
 
136 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  33.67 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  29.6 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  31.96 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  33.67 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  30.65 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  29.6 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  32.65 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  31.63 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  30.4 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  31.63 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  29.7 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  32.65 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  33.67 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  32.65 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  27.2 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  32.65 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  28.8 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  32.8 
 
 
357 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  28 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  30.4 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  30.4 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  28.8 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  31.63 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  31.63 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  31.63 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  31.63 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  30.16 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  30.16 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  30.16 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  31.63 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  31.63 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  32 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  30.25 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  29.6 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  28.8 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  32.35 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  31.45 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  31.96 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  30.93 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  29.03 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  31.25 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  29.03 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  28.8 
 
 
136 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  29.59 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  29.41 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
252 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  28.8 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  34.23 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  29.59 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  29.6 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  29.51 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  29.59 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  29.59 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  31 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  30 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  30.61 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  29.6 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  29.59 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  28.69 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  25.41 
 
 
143 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.5 
 
 
263 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  28.81 
 
 
599 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  30.21 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  27.12 
 
 
255 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  27.2 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  29.59 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  29.37 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  27.59 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  29.13 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  29.69 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.129637 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>