35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32938 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32938  predicted protein  100 
 
 
208 aa  418  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04950  potassium channel, putative  23.79 
 
 
807 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.127919  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  29.24 
 
 
356 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  28.83 
 
 
265 aa  55.1  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  41.94 
 
 
128 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  28.09 
 
 
274 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  32.14 
 
 
469 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  29.35 
 
 
397 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  24.85 
 
 
277 aa  45.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  41.07 
 
 
277 aa  45.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  38 
 
 
131 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  39.66 
 
 
253 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  41.18 
 
 
341 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2059  K+ channel inward rectifier domain-containing protein  36.26 
 
 
288 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  40.68 
 
 
430 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  35.37 
 
 
438 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  35.37 
 
 
408 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  48.72 
 
 
517 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0590  Ion transport 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
114 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0706  hypothetical protein  29.76 
 
 
114 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  42.59 
 
 
330 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  34.78 
 
 
276 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  52.63 
 
 
79 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4630  hypothetical protein  36.51 
 
 
114 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696227  hitchhiker  0.00000000000143872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0642  hypothetical protein  28.57 
 
 
114 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0440411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0731  hypothetical protein  28.57 
 
 
114 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0746600000000001e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0586  potassium channel protein  28.57 
 
 
114 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000724625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0585  potassium channel protein  28.57 
 
 
114 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104452  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0676  hypothetical protein  28.57 
 
 
114 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000494149  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  38.89 
 
 
448 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0803  hypothetical protein  28.57 
 
 
114 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000064976  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  32.2 
 
 
700 aa  42.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  43.75 
 
 
350 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  28.76 
 
 
409 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  40.82 
 
 
335 aa  41.2  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>