More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0933 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0933  elongation factor G  100 
 
 
719 aa  1484    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7102  elongation factor G  47.34 
 
 
710 aa  703    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  43.62 
 
 
707 aa  625  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  38.52 
 
 
699 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  36.11 
 
 
691 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  37.71 
 
 
690 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  36.58 
 
 
690 aa  501  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  35.56 
 
 
691 aa  497  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  36.03 
 
 
691 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  34.97 
 
 
693 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  35.61 
 
 
691 aa  492  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  36.04 
 
 
696 aa  485  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  36.44 
 
 
679 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  37.55 
 
 
680 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  35.61 
 
 
695 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  34.16 
 
 
694 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  36.71 
 
 
692 aa  462  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  35.1 
 
 
682 aa  458  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  34.17 
 
 
695 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  36.24 
 
 
703 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  33.84 
 
 
692 aa  455  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  33.01 
 
 
683 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  35.68 
 
 
701 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  35.41 
 
 
701 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  34.85 
 
 
697 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  33.43 
 
 
688 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  35.71 
 
 
706 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  34.59 
 
 
685 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  35.7 
 
 
701 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  34.75 
 
 
703 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  33.76 
 
 
682 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  32.5 
 
 
686 aa  434  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  32.92 
 
 
683 aa  435  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  34.17 
 
 
692 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  33.47 
 
 
690 aa  433  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  32.35 
 
 
696 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  32.49 
 
 
696 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  34.27 
 
 
683 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  33.94 
 
 
691 aa  428  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  34.21 
 
 
673 aa  428  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0222  elongation factor G  33.74 
 
 
683 aa  428  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  33.47 
 
 
694 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  33.52 
 
 
685 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  32.91 
 
 
667 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  34.17 
 
 
691 aa  428  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  32.91 
 
 
696 aa  422  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  35.72 
 
 
692 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  34.92 
 
 
691 aa  422  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  33.43 
 
 
670 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  34.73 
 
 
700 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  34.65 
 
 
692 aa  419  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  36.06 
 
 
695 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  34.6 
 
 
692 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  34.08 
 
 
691 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  32.54 
 
 
696 aa  421  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  35.39 
 
 
701 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  34.45 
 
 
683 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  33.75 
 
 
693 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.22 
 
 
701 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  33.94 
 
 
689 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1236  elongation factor G  34.49 
 
 
694 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0596578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  34.31 
 
 
689 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  35.14 
 
 
704 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04525  elongation factor G  35.41 
 
 
690 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00693327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  34.89 
 
 
692 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  33.84 
 
 
691 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  33.57 
 
 
691 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  33.94 
 
 
697 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  33.84 
 
 
691 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3804  translation elongation factor G  34.83 
 
 
701 aa  419  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  34.59 
 
 
698 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  35.92 
 
 
695 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  34.15 
 
 
704 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  32.54 
 
 
691 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  35.29 
 
 
695 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  34.32 
 
 
697 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  34.46 
 
 
692 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  35.04 
 
 
697 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  34.22 
 
 
693 aa  412  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  34.91 
 
 
704 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  31.94 
 
 
691 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  35.01 
 
 
697 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  33.61 
 
 
691 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  34.51 
 
 
694 aa  415  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  34.89 
 
 
697 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  33.8 
 
 
692 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1199  elongation factor G  34.49 
 
 
694 aa  416  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  33.99 
 
 
692 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  34.03 
 
 
698 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  32.23 
 
 
694 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  34.75 
 
 
692 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2102  elongation factor G  35.61 
 
 
705 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.990923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  34.44 
 
 
698 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  34.26 
 
 
701 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  34.63 
 
 
698 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  34.45 
 
 
691 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  35.04 
 
 
697 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  34.12 
 
 
700 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  34.26 
 
 
701 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  34.63 
 
 
698 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>