More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0224 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0224  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  411  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0524  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.77 
 
 
192 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1119  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  49.43 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.628866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2433  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.03 
 
 
191 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0996  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.2 
 
 
189 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.643344  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.86 
 
 
193 aa  168  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5115  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.24 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1097  hypothetical protein  38.12 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.177392 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02065  putative transmembrane protein  46.32 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808084  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.56 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  29.56 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.35 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  29.5 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  28.35 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.29 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.21 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.46 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.65 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.87 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.92 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.37 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.5 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.8 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.75 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.27 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  27.75 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.75 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.75 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.75 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  27.75 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.75 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.75 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.75 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.75 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.23 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.21 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.5 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.02 
 
 
209 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.55 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  25.49 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  28.26 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.26 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.67 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.86 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.5 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.8 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.82 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.18 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  26.15 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  25.52 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  26.21 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.53 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  26.15 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  29.5 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.71 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.67 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.96 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  29.41 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  26.4 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.27 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  26.4 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  26.4 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.15 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  26.4 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  26.4 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.46 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  26.09 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  26.4 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  26.42 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  26.4 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  26.4 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.51 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.5 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0442  hypothetical protein  30.57 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  26.09 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  26.09 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.42 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.5 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  26.34 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.45 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  25.67 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.75 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.28 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.38 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.23 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  27.27 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  22.83 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  27.27 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  27.27 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>