67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4156 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  100 
 
 
184 aa  380  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  75.28 
 
 
182 aa  286  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  75.84 
 
 
182 aa  271  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  64.04 
 
 
181 aa  255  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  41.81 
 
 
182 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  46.07 
 
 
182 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  46.07 
 
 
182 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  37.64 
 
 
180 aa  137  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  44.81 
 
 
176 aa  131  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  39.64 
 
 
181 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  39.23 
 
 
170 aa  111  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  44.85 
 
 
165 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.46 
 
 
170 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  38.46 
 
 
170 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.46 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.46 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.46 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.46 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.46 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  38.46 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.46 
 
 
170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  38.46 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  36.84 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  30.59 
 
 
180 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  34.78 
 
 
179 aa  98.6  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  33.92 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  31.33 
 
 
186 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  31.76 
 
 
184 aa  94.4  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  33.33 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  31.87 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  29.56 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  38.18 
 
 
152 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  32.16 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  31.18 
 
 
181 aa  89  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  35.19 
 
 
173 aa  89  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  37.04 
 
 
173 aa  89  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  34.92 
 
 
180 aa  89  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  30.82 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  29.81 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  32.5 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  35.61 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  30.77 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  33.33 
 
 
181 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  35.11 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  32.16 
 
 
181 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  31.58 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  33.33 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  36.09 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  33.08 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  35.61 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  28.4 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  31.14 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  28.57 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  28.57 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  28.57 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  32.33 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  31.06 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  31.06 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  29.92 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  29.92 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  27.68 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  31.11 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  31.13 
 
 
178 aa  55.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  30.84 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  25.86 
 
 
224 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  24.59 
 
 
178 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2617  hypothetical protein  22.47 
 
 
181 aa  40.8  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.796687  normal  0.318237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>