40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3785 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
333 aa  698    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.55 
 
 
352 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.02 
 
 
341 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.02 
 
 
341 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 
353 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.05 
 
 
341 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.11 
 
 
346 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.53 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  28.14 
 
 
394 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.83 
 
 
355 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  28.66 
 
 
381 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.57 
 
 
377 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.3 
 
 
377 aa  99  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.7 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  26.32 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.33 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.47 
 
 
410 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.33 
 
 
398 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  28.19 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.78 
 
 
379 aa  90.1  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.98 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.89 
 
 
408 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.45 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  28.62 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  24.25 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.49 
 
 
322 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.44 
 
 
894 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 
870 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 
876 aa  46.2  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 
870 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
870 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.62 
 
 
870 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.62 
 
 
870 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1518  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.14 
 
 
336 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000454364  hitchhiker  0.00000000880332 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.86 
 
 
885 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 
870 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>