More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3708 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 		 120 aa  206  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  83.19 
 
 		 120 aa  206  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  81.74 
 
 		 117 aa  201  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  83.02 
 
 		 119 aa  186  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  73.5 
 
 		 119 aa  182  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  76.32 
 
 		 119 aa  177  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  70.59 
 
 		 119 aa  176  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  64.66 
 
 		 121 aa  157  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  61.16 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  61.02 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  61.02 
 
 		 128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16731  50S ribosomal protein L22  62.28 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  64.22 
 
 		 128 aa  149  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1960  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1124  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19981  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.508737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  55.65 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  62.14 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  57.43 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  57.43 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  55.34 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  60.19 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  58.65 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  54.95 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  53.57 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  50.43 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  55.14 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  56.6 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  49.57 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  50.96 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  51.79 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18674  Plastid ribosomal protein L22 large ribosomal subunit  55.67 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034637  normal  0.692976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  51.33 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  50.45 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  52.68 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  52.68 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  52.68 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  53.33 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  52.83 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  53.15 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  51.89 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  48.72 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  52.34 
 
 		 109 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  54.81 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  47.71 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  45.76 
 
 		 121 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  49.56 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  52.25 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  50 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  49.55 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0410  50S ribosomal protein L22P  53.27 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  51.43 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  54.21 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 120 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  50 
 
 		 122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  45.76 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  46.55 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0772  ribosomal protein L22  55.14 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0420654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  52.34 
 
 		 212 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  53.27 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  47.66 
 
 		 110 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  48.67 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3292  50S ribosomal protein L22  51.92 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000257893  hitchhiker  0.00000196654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0058  50S ribosomal protein L22  53.85 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000680937  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  57 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  48.67 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 		 111 aa  105  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  49.52 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2945  50S ribosomal protein L22  51.92 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396583  decreased coverage  0.000000112482 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0055  50S ribosomal protein L22  53.85 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000185707  hitchhiker  6.04207e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  58.65 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>