47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2879 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2879  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  497  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1665  hypothetical protein  52.74 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2433  hypothetical protein  50.21 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000001996  hitchhiker  0.000000966182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1540  hypothetical protein  45.78 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.625803  normal  0.0166708 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2005  hypothetical protein  28.81 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1582  hypothetical protein  28.89 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0214214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 		 363 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  22.16 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.56 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  25.13 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.56 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  23.26 
 
 		 393 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 294 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  22.98 
 
 		 393 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1931  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 258 aa  45.4  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25 
 
 		 371 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  47.83 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25 
 
 		 371 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  47.83 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2039  homoserine O-acetyltransferase  34.21 
 
 		 382 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1759  homoserine O-acetyltransferase  32.91 
 
 		 381 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  22.91 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 		 331 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4155  homoserine O-acetyltransferase  29.91 
 
 		 379 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.915842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  35.9 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  45.83 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 		 323 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0474  homoserine O-acetyltransferase  29.91 
 
 		 379 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.540112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5049  homoserine O-acetyltransferase  28.97 
 
 		 379 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 256 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 		 266 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 		 266 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.76 
 
 		 371 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0368  homoserine O-acetyltransferase  28.04 
 
 		 379 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.626421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  21.35 
 
 		 258 aa  42  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  34.62 
 
 		 273 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 281 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  52.5 
 
 		 398 aa  42  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0437  homoserine O-acetyltransferase  28.44 
 
 		 381 aa  42  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  31.68 
 
 		 319 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5323  homoserine O-acetyltransferase  29.91 
 
 		 379 aa  42  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>