34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1665 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1665  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  507  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2879  hypothetical protein  52.74 
 
 
241 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2433  hypothetical protein  52.17 
 
 
252 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000001996  hitchhiker  0.000000966182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1540  hypothetical protein  43.35 
 
 
236 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.625803  normal  0.0166708 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2005  hypothetical protein  32.39 
 
 
257 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1582  hypothetical protein  29.15 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0214214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  47.92 
 
 
286 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1773  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  19.81 
 
 
318 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.8 
 
 
370 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 
339 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 
339 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
293 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1113  hypothetical protein  42 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  51.28 
 
 
344 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  42 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.53 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  45.65 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.53 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.01 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 
352 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  23.73 
 
 
332 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 
284 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0662  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.212326  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
431 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  22.36 
 
 
303 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
294 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  24.86 
 
 
315 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38202  epoxide hydrolase, soluble (sEH)  22.51 
 
 
321 aa  42  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.927116  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 
264 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54746  soluble epoxide hydrolase  23.4 
 
 
321 aa  42  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>