21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2005 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2005  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  537  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1582  hypothetical protein  52.97 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0214214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1665  hypothetical protein  32.39 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2879  hypothetical protein  28.81 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2433  hypothetical protein  26.83 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000001996  hitchhiker  0.000000966182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1540  hypothetical protein  26.38 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.625803  normal  0.0166708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  22.8 
 
 		 340 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.58 
 
 		 369 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  24.88 
 
 		 341 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  22.34 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  23.2 
 
 		 340 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  22.33 
 
 		 320 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>