14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1540 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1540  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.625803  normal  0.0166708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2879  hypothetical protein  45.22 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1665  hypothetical protein  44.3 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2433  hypothetical protein  45.76 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000001996  hitchhiker  0.000000966182 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1582  hypothetical protein  28.05 
 
 		 255 aa  95.1  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0214214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2005  hypothetical protein  27.27 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4801  prolyl aminopeptidase  25.17 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3510  hypothetical protein  32.67 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.875172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 431 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 		 437 aa  42.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4784  prolyl aminopeptidase  23.84 
 
 		 286 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 331 aa  41.6  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>