27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3256 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  100 
 
 		 810 aa  1662    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  28.33 
 
 		 845 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  28.87 
 
 		 848 aa  210  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.31 
 
 		 755 aa  152  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  28.11 
 
 		 806 aa  136  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  27.1 
 
 		 800 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.4 
 
 		 808 aa  129  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.12 
 
 		 757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.15 
 
 		 808 aa  115  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 757 aa  110  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  25.47 
 
 		 737 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  22.32 
 
 		 799 aa  108  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  30.58 
 
 		 850 aa  108  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  22.74 
 
 		 735 aa  107  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  22.48 
 
 		 717 aa  107  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.57 
 
 		 719 aa  104  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  30.96 
 
 		 731 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  31.47 
 
 		 750 aa  98.6  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.16 
 
 		 838 aa  94.4  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.87 
 
 		 780 aa  91.3  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 		 837 aa  90.5  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  22.66 
 
 		 761 aa  86.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 		 830 aa  80.1  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  25.93 
 
 		 812 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.13 
 
 		 762 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1152  CRISPR-associated Csm1 family protein  24.53 
 
 		 755 aa  47.8  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00402598  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0964  CRISPR-associated Cmr2 family protein  28.73 
 
 		 477 aa  44.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.662431  normal  0.765777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>